- 学術雑誌（Original Papers）
- 12. K Ohigashi, A Mizuguti, K Nakatani, Y Yoshimura, K Matsuo. Modeling
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11. 山口のどか，水口亜樹，吉岡俊人. 福井県の水稲13品種における越冬性の違い. 北陸作物学会報 50:10-14 (2015)
10. K Ohigashi, A Mizuguti, Y Yoshimura, K Matsuo, T Miwa. A new method
for evaluating flowering synchrony to support the temporal isolation of
genetically modified crops from their wild relatives. Journal of Plant
Research 127: 109-117 (2013)
9. Y Yoshimura, A Mizuguti, K Matsuo. Analysis of the seed dispersal patterns
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8. A Nishiwaki, A Mizuguti, S Kuwabara, Y Toma, G Ishigaki, T Miyashita,
T Yamada, H Matuura, S Yamaguchi, AL Rayburn, R Akashi, JR Stewart. Discovery
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5. A Mizuguti, Y Yoshimura, K Matsuo. Flowering phenologies and natural
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Phenology. Grassland Science 50(1): 9-14 (2004)
3. 水口亜樹，西脇亜也，小山田正幸，杉本安寛. 宮崎大学構内における開花時期の異なるチガヤ（Imperata cylindrica (L)
BEAUV.）２タイプの分布. 宮崎大学農学部研究報告 49(1・2): 89-94 (2003)
2. 水口亜樹，西脇亜也，杉本安寛. 開花時期の異なるチガヤ(Imperata cylindrica (L.) BEAUV.）２タイプ間の形態的差異.
日本草地学会誌 49(4): 324-329 (2003)
1. 水口亜樹，西脇亜也，小山田正幸. チガヤ(Imperata cylindrica (L.) BEAUV.）における開花時期の異なるタイプ間の種子発芽特性の違い.
日本草地学会誌 48(3): 216-220 (2002)
- 著書・訳書（Books）
- 2. 水口亜樹. 第３章 外来植物としての生き方, 大学連携リーグ双書第4号 里地里山里海の生きもの学, 福井県大学連携リーグ, 51-68
(2014)
1. 水口亜樹.「花粉」「自家受精」「雑種強勢」「硬実」. 雑草学事典（日本雑草学会編）（2011）
- 総説・解説（Reviews）
- 11. 水口亜樹. 遺伝子組換え作物の生物多様性影響評価の現状と課題. 日本生態学会誌 66: 319-323 (2016)
10. 水口亜樹. 日本国内における遺伝子組換え作物の生態リスク評価のための研究 植調 49：92-95（2015）
9. 赤坂宗光，斎藤達也，大澤剛士，黒川俊二，水口亜樹，下野嘉子，西田智子, 日本国内における外来植物を扱う研究の現状と求められる課題, 雑草研究
57(2):81-92 (2014)
8. 水口亜樹. 遺伝子組換え作物の生態リスク評価における雑草学の重要性, 九州の雑草 43: 20-24 （2014)
7. 水口亜樹. 遺伝子組換えダイズとナタネの生態リスク評価に関する基礎的研究, 雑草研究 56(2): 100-103（2011）
6. 水口亜樹. 永井孝志，浅井元朗，池田浩明. 総説. 農業生態系におけるリスク評価の統合に向けて：農薬・雑草・遺伝子組換え作物の生態リスク評価から全体のつながりを意識する.
日本生態学会誌 61(2): 133-153 (2011)
5. 水口亜樹. 特集2 統計解析（再？）入門, 実験計画の立て方とＲを用いた分散分析－実験計画法に応じた分散分析の実行. 雑草研究 56(1):
24-34（2011）
4. 水口亜樹. コラム 緑化植物 ど・こ・ま・で・き・わ・め・る チガヤ(Imperata cylindrica (L.) Beauv.) 日本緑化工学会誌 35(3)：481（2009）
3. 冨永達，西脇亜也，水口亜樹，江崎次男. 雑草モノグラフ５．チガヤ (Imperata cylindrica (L.) Beauv.) 雑草研究 52(1):
17-27 (2007)
2. 西脇亜也，水口亜樹. 特集 クローナル植物の繁殖戦略, クローナル植物の集団内における個体差. 日本生態学会誌 57(2): 251-255
(2007)
1. 水口亜樹，西脇亜也. チガヤ２タイプ間の形態・生態・遺伝子における変異, 植調 40(8): 307-314（2006）
